ESSENTIEL - Les indemnités journalières de Sécurité sociale (IJSS)
Pourquoi cet essentiel ?
Lorsqu'un salarié est en arrêt de travail, son employeur n'est pas toujours le seul à intervenir dans sa rémunération. La Sécurité sociale peut verser des indemnités journalières (IJSS) destinées à compenser tout ou partie de la perte de salaire.
Les IJSS interviennent dans de nombreuses situations : maladie, accident du travail, maternité, paternité ou encore adoption. Leur traitement influence directement le bulletin de paie, notamment lorsqu'un maintien de salaire ou une subrogation est mis en place.
Cet essentiel présente le fonctionnement général des IJSS, leurs principaux cas d'application et leurs conséquences en paie.
Le principe
Les indemnités journalières de Sécurité sociale sont des prestations versées par l'Assurance Maladie afin de compenser la perte de rémunération d'un salarié dont le contrat de travail est suspendu pour certains motifs.
Selon la situation, elles peuvent être :
- versées directement au salarié ;
- versées à l'employeur en cas de subrogation ;
- complétées par un maintien de salaire légal ou conventionnel.
En cas d'arrêt maladie, les IJSS sont en principe versées à partir du 4ᵉ jour d'arrêt, après application d'un délai de carence de trois jours (sauf exceptions prévues par les textes ou certaines conventions collectives).
Les principales situations donnant droit aux IJSS
| Motif de l'arrêt | IJSS versées ? | Particularités |
|---|---|---|
| Maladie non professionnelle | Oui | Délai de carence en principe de 3 jours |
| Accident du travail | Oui | Pas de délai de carence Sécurité sociale |
| Maladie professionnelle | Oui | Régime spécifique |
| Congé maternité | Oui | Règles spécifiques de calcul |
| Congé paternité | Oui | Indemnisation spécifique |
| Congé d'adoption | Oui | Oui |
| Temps partiel thérapeutique | Oui | Sous conditions |
Le tableau comparatif : Maladie / AT-MP / Maternité / Paternité
Carence, taux de calcul, durée d'indemnisation, particularités : chaque type d'absence indemnisée obéit à ses propres règles, et il est facile de les confondre.
Ce tableau réunit sur une seule page les quatre situations les plus courantes pour permettre une comparaison directe et éviter les erreurs classiques (comme appliquer le régime de la maladie ordinaire à un accident du travail).
Un support de référence à garder sous la main lors du traitement d'un arrêt.
Qui verse les IJSS ?
| Situation | Versement |
|---|---|
| Pas de subrogation | La CPAM verse directement les IJSS au salarié |
| Subrogation | La CPAM verse les IJSS à l'employeur, qui maintient le salaire |
Le circuit des IJSS
Entre l'arrêt de travail du salarié et son impact sur la fiche de paie, plusieurs acteurs interviennent dans un ordre précis : le salarié, l'employeur, la CPAM, puis le bulletin de paie lui-même.
Ce schéma retrace ce circuit en quatre étapes, de la transmission de l'arrêt à la traduction comptable du versement des IJSS.
Il permet de visualiser en un coup d'œil qui fait quoi, et à quel moment, que l'on soit gestionnaire paie en cabinet ou en entreprise.
Circuit du paiement des IJSS avec et sans subrogation
C'est souvent le point qui bloque le plus les apprenants : qui verse quoi, et à qui ?
Ce schéma met côte à côte les deux mécanismes pour lever l'ambiguïté.
- Sans subrogation, le salarié perçoit les IJSS directement de la CPAM, complétées le cas échéant par l'employeur.
- Avec subrogation, c'est l'inverse : l'employeur avance le salaire habituel et se fait rembourser les IJSS par la CPAM. Une fois ce schéma en tête, la distinction devient évidente.
Les conséquences sur le bulletin de paie
| Élément | Impact |
|---|---|
| Salaire brut | Peut être diminué en raison de l'absence |
| Maintien de salaire | Selon la loi ou la convention collective |
| IJSS | Peuvent apparaître directement ou indirectement selon la subrogation |
| Cotisations sociales | Peuvent être modifiées |
| Net à payer | Variable selon le maintien de salaire |
| Net imposable | Peut être impacté selon la nature des sommes versées |
Les différents acteurs
| Acteur | Rôle |
|---|---|
| Salarié | Transmet son arrêt de travail |
| Employeur | Établit l'attestation de salaire et calcule le bulletin |
| CPAM | Vérifie les droits et verse les IJSS |
| Organisme de prévoyance | Peut compléter les revenus selon le contrat |
Maintien de salaire et IJSS
Les IJSS ne remplacent pas automatiquement la totalité du salaire.
Selon les situations, le salarié peut bénéficier :
- d'un maintien de salaire prévu par le Code du travail ;
- d'un maintien plus favorable prévu par la convention collective ;
- d'un complément versé par un organisme de prévoyance.
L'employeur déduit généralement les IJSS du montant du salaire maintenu.
Cas particuliers
| Situation | Ce qu'il faut retenir | Pour aller plus loin |
|---|---|---|
| Subrogation | L'employeur perçoit directement les IJSS | Mémo : La subrogation |
| Accident du travail | Régime plus favorable | Mémo dédié |
| Congé maternité | Calcul spécifique | Mémo dédié |
| Temps partiel thérapeutique | Salaire + IJSS | Mémo dédié |
| Reprise anticipée | Les IJSS cessent à la reprise effective | Mémo dédié |
Les erreurs les plus fréquentes
| Erreur | Conséquence | Bon réflexe |
|---|---|---|
| Confondre maintien de salaire et IJSS | Mauvais calcul du bulletin | Distinguer les deux mécanismes |
| Oublier la subrogation | Erreur de paiement | Vérifier l'attestation de salaire |
| Appliquer le délai de carence dans tous les cas | Bulletin erroné | Identifier le motif de l'arrêt |
| Oublier les dispositions conventionnelles | Maintien de salaire incorrect | Consulter la convention collective |
| Ne pas rapprocher les IJSS perçues des montants repris en paie | Régularisations ultérieures | Contrôler les décomptes CPAM |
Bonnes pratiques
| Bon réflexe | Pourquoi ? |
|---|---|
| Identifier le motif exact de l'arrêt | Les règles d'indemnisation diffèrent |
| Vérifier les droits au maintien de salaire | Ils varient selon l'ancienneté et la convention |
| Contrôler les décomptes de la CPAM | Éviter les écarts de paie |
| Vérifier la subrogation | Sécuriser les paiements |
| Archiver les justificatifs | Faciliter les contrôles et les régularisations |
En résumé
| Point clé | À retenir |
|---|---|
| Les IJSS compensent une perte de salaire | Oui |
| Elles sont versées par la Sécurité sociale | Oui |
| Elles concernent plusieurs types d'arrêts | Oui |
| Elles peuvent être versées à l'employeur en cas de subrogation | Oui |
| Elles peuvent être complétées par un maintien de salaire | Oui |
| Elles influencent directement le bulletin de paie | Oui |
Dans la bibliothèque
Essentiels
- Les absences du salarié
- Le maintien de salaire
- Le plafond de la Sécurité sociale
- Les cotisations sociales
Mémos
- Comment calculer les IJSS maladie ?
- Comment fonctionne la subrogation ?
- Comment comptabiliser les IJSS sur le bulletin de paie ?
- Quel est le délai de carence ?
- Les IJSS en cas d'accident du travail
- Les IJSS maternité et paternité
- Comment lire un décompte CPAM ?



